睡眠呼吸暂停综合征患者夜间睡眠时反复出现血氧降低、频繁觉醒，重者多达每昼夜百余次,长期反复发作对患者的身体健康及生活质量造成极大危害。心脑血管疾病的发生率明显上升，严重时可夜间猝死；它还是司机及高空作业人员发生意外事故的原因之一。可见打鼾及睡眠呼吸暂停不仅仅是一种噪声，吵得同卧室的人不安，而且会危及患者的生命安全。
睡眠呼吸暂停综合征对身体有以下危害。
高血压
40%~60%的阻塞型睡眠呼吸暂停综合征患者有高血压病史，与其他高血压患者不同的是，他们的血压大多在早晨最高，清晨头痛、头晕明显，单纯药物治疗效果差。有效治疗呼吸暂停后，高血压常可下降，有的甚至可降至正常范围。
心律失常
睡眠呼吸暂停综合征患者睡眠时心率快慢交替，心率波动幅度较大，多为窦性心动过速，但也有短阵房性或室性心动过速，慢者出现心脏传导阻滞、心脏停跳。几乎有一半的睡眠呼吸暂停综合征患者会出现各种各样的心律失常，有些甚至是致命的。单纯治疗睡眠呼吸暂停常可取得良好效果，但易被误诊为心脏病而误治。
脑血管病
我们都知道，脑血管意外即通常所说的“中风”，好发于夜间。一夜之间，患者就会口眼歪斜，肢体瘫痪。研究发现，睡觉时打鼾及呼吸暂停可以增加脑血管病的发病率及死亡率。53%以上的男性脑血管病患者有长期习惯性打鼾史，35%的患者脑血管意外发生在睡眠时，与打鼾及呼吸暂停密切相关。越来越多的证据表明打鼾及呼吸暂停是脑血管病的一个独立危险因素，对脑血管意外的发生及病情加重有十分重要的作用。
过度嗜睡
睡眠呼吸暂停引起的频繁觉醒会严重扰乱患者的睡眠，深睡期减少甚至消失，患者长期处于睡眠不足的状态。白天嗜睡的严重程度与睡眠呼吸暂停综合征的严重程度密切相关。白天困倦嗜睡，会严重影响工作、学习、生活，尤其是司机、从事高空作业的患者，意外事故发生率很高，可危及自己及他人的生命安全。
精神及心理危害
智力减退、性格及行为异常，与睡眠呼吸暂停综合征的关系已十分明确，睡眠呼吸暂停综合征患者与家庭成员、同事间的人际关系常不太融洽。抑郁症等精神疾病也可见于睡眠呼吸暂停综合征患者，有的研究还发现睡眠呼吸暂停与老年痴呆症的发生也有一定关系。
内分泌代谢紊乱
性欲减退或阳痿在男性睡眠呼吸暂停综合征患者中较为常见。统计资料表明，50例睡眠呼吸暂停综合征患者中44%有不同程度的性功能障碍，近来的研究还表明睡眠呼吸暂停引起的内分泌代谢功能紊乱，可以加重肥胖。
肾脏功能
睡眠呼吸暂停综合征患者夜间睡眠时尿量增多，次数可达3次以上，部分患者尿中蛋白含量增加。
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