公务员体检不合格的情况有很多。具体可以参考《公务员体检通用标准》和《公务员体检特殊标准》。这些标准里面对不合格的情况都有做详细的说明。例如，以下是一些常见的不合格情况：
患有各种恶性肿瘤、结缔组织疾病(如系统性红斑狼疮等)、内分泌系统疾病(如糖尿并尿崩症、肢端肥大症等)、血液病的，为不合格。
患有慢性支气管炎、支气管哮喘、支气管扩张、活动性肺结核、结核性胸膜炎及其他呼吸系统慢性疾病的，为不合格。
心脏听诊，各瓣膜区有明显收缩期杂音及舒张期杂音，经心音图确认的，为不合格。
心率60次/分钟，或者次/分钟的，经心功能等特殊检查，确认为非生理性的心动过缓或心动过速的，为不合格。
非单纯缺铁性贫血及血红蛋白男性低于80g/L，女性低于70g/L的，不合格。
尿液检查蛋白、管型、红细胞数、白细胞数阳性，有临床意义的，不合格。
肝功能检查具有下列情形之一者，为不合格(一)SACT高于正常参考值(医院的正常参考值);(二)乙肝两对半异常。
双眼的视力在经过了矫正之后低于4.8，或者是存在很明显的视功能损害眼病，在体检上会被认为不合格。
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